Педиатрическая служба в Заволжском районе была основана в 1930 г., когда была открыта Тверицкая амбулатория на 2 кабинета – терапевтический и педиатрический приемы (руководитель амбулатории – Струлева София Ивановна). В 1945 году была организована больница № 5, в которой уже функционировал детский кабинет (главный врач – Неусыпин Валентин Иванович). В 1963 г. больница №5 была переименована в поликлинику № 3, в которой было создано детское поликлиническое отделение (главный врач поликлиники до 1986 года – Чуфаровский Сергей Александрович). Считается, что 60-е годы являются периодом создания детского отделения поликлиники. До 1965 года отделение располагалось в вагончике на ст. Урочь, а после – в помещении бывшего родильного дома на Тверицкой Набережной р. Волги. С 1984 по 1993 год детское отделение располагалось в помещении областной больницы. В 1988 г. поликлиника № 3 переименована в МСЧ ЯЗДА, в состав которого и входило детское отделение. Кроме того с 1989 г. в состав детского отделения МСЧ ЯЗДА стало входить и детское отделение больницы № 6. Главным врачом МСЧ в этот период был Лушников Евгений Андреевич, заместителем главного врача по поликлинике – Лебедев Евгений Павлович Управлением здравоохранения мэрии г. Ярославля в 1993 году детское отделение выделено в самостоятельное ЛПУ – Муниципальное учреждение здравоохранения Детская поликлиника № 5. С января 2012 года (в связи с передачей муниципальных учреждений здравоохранения в собственность Ярославской области) переименовано в государственное учреждение здравоохранения Ярославской области Детская поликлиника № 5.